nature 论文:ai为膜蛋白设计了一层“装甲”,课题就叫《de novo design of gpcr exoframe modula

大年初一,浙江大学的医学院和计算机学院联手出了篇Nature论文。这次他们用AI为膜蛋白设计了一层“装甲”,课题就叫《De novo Design of GPCR Exoframe Modulators》,把虚拟现实技术拿来给蛋白骨架绘图。文章给细胞里的“信号接收器”——G蛋白偶联受体(GPCR)找了个帮手,提出了“外骨骼式”调控的新主意。 文章通讯作者张岩和章敏带领团队打造了一种叫做GEM(GPCR Exoframe Modulator)的分子,这是一种能直接抓住GPCR跨膜域的药物。传统药大多是往正构口袋里塞东西,GEM不一样,它是通过改变受体的构象状态来实现精细调控。更绝的是,团队把AI设计的模块嵌进受体本体,硬生生把经典的七次跨膜螺旋变成了九次甚至十三次,这样就能随心操控下游的信号通路了。 论文的第一作者程诗卓是“医药+X”项目里的博士生,一周要跑三个课题组:医学组、计算机组还有交叉组。他一边学人体知识,一边码代码,硬是把那些看不懂的遗传密码翻译成了计算机能理解的逻辑语言。结果证明这套体系特别好使,把“可控能力”发挥到了极致。 这次投稿正好赶在一年前的同一天大年初一。文章的团队里还有浙江大学医学院的郭嘉、周云利、罗序梅,以及苏州大学药学院的张谷芳。据张岩透露,他们想用这种新技术给那些没法治的病找新路子,比如部分帕金森样综合征。 这事儿是中国青年报在杭州2月17日报道的。课题组用VR绘制了蛋白骨架(图),还展示了GEM是怎么救活那些失活的突变体的(图)。大家看论文里有张合影:从左至右是章敏、张岩和程诗卓(图)。