1685年2月，紫禁城的皇帝玄烨，也就是康熙，在御案上摊开了一张黑龙江的地图，把“雅克萨”这个名字第一次放进了朝廷讨论的议程。皇帝召集了众大臣，最终定下了一个策略：先去招抚，如果他们不听劝，就给他们断粮毁田，把城攻破，然后再班师回朝。 到了5月份，3000名八旗精锐从瑷珲出发，兵分两路前往雅克萨：水路走冰缝，陆路穿森林。他们像一把钢楔子一样直插过去。早在3月份，康熙已经任命了都统彭春为黑龙江将军，班达尔善、马剌还有佟宝给彭春当副手。清军的哨探先潜入雅克萨周围，偷偷观察了一个月，还抓了7个俄军士兵来审讯。结果发现哥萨克首领托尔布津带的人马不到一千，城防虽然坚固但缺少火炮和粮草。 4月份的时候，沙俄又调了一千人马增援。清军于是决定用声东击西的办法，让火炮掩护作战。5月30日清军到达了雅克萨城下。第二天早上他们用弓箭把一份满语和俄语的通告射进城里：要求俄军立即退出雅克萨回雅库斯克去，如果不答应就会被攻破城池。 托尔布津仗着自己的木城结实、武器厉害，根本不理睬这道通牒，还派了40多个“罗刹兵”乘筏子来增援。结果半数人被击中淹死了，还有15个人被活捉了。6月26日凌晨战斗打响了：南面的清军挖战壕射箭像下雨一样；北、东、西三面的大炮也开始轰鸣；水师把江面封锁住防止敌人逃跑。 一直打到中午木城还是没被攻破。清军就改用火攻——在城下堆积柴火点着大火。托尔布津一看大势已去就派人求降：愿意放弃雅克萨撤回雅库斯克，只带走枪械上缴大炮。彭春答应了他的请求。 受降仪式上清点了十多门火炮和几百支枪后，清军派了一千多人护送俄军及其眷属到额尔古纳河口让他们自己回国。“副头目巴什里”和其他45个俄国人不愿意回国就留在了盛京。 最后雅克萨的木城被放火烧成了焦土后清军就回到瑷珲班师回朝了。