美国海关及边境保护局也跟着国土安全部一块儿停摆了，这给旅客带来了极大的麻烦。这段时间的安检队伍实在是太长了，让人感到非常无奈和烦躁。休斯敦、亚特兰大、新奥尔良等主要的航空枢纽在最近两天都遇到了这个问题，安检队列能够排上几个小时，让很多旅客都快要受不了了。过去只要十几分钟就能完成的事情，现在居然要等上几个小时。休斯敦威廉·霍比机场，队伍一度排到了3个多小时；新奥尔良国际机场的安检线直接从航站楼蔓延到了停车场。因为这个问题，机场方面建议旅客们提前至少四个小时到达机场。比如有一位23岁的游客卡莉·施密特，原本打算从得克萨斯州休斯敦去佛罗里达州度假，但由于排队安检花了三个小时，她错过了航班起飞时间，只能改日再飞。卡莉说：“现在的我只想赶紧坐上飞机，去哪儿都行。”现在正值美国春假出行高峰期，预计三四月份的客流量会达到1.71亿人次，同比增长4%。即使在平常情况下安检人手也已经很紧张了。再加上这次国土安全部停摆影响到了运输安全管理局员工的工资和工作条件，很多人选择请假或者缺勤了。这让原本就捉襟见肘的人手更加不够用了。克里斯·苏努努是美国航空协会的首席执行官，他呼吁国会尽快解决问题，让国土安全部恢复正常运作。他说美国交通安全人员不应该被当成政治筹码来对待。民主党和共和党还在为这个问题争吵不休。约翰·图恩是参议院共和党领袖，他批评民主党不愿意妥协。他说谈判已经进行了一个多月了，民主党提交了两份几乎一模一样的方案，没有任何妥协迹象。民主党则坚持要求改革移民与海关执法局，否则不同意拨款法案。