alk 基因检测这事儿真挺有意思

听说了没,ALK基因检测这事儿真挺有意思。以前觉得ALK突变就是基因多表达了点,谁能想到它最爱干的是跟别的基因“握手言和”呢?在中国非小细胞肺癌患者里,这比例差不多占5.3%,排在那几个主要驱动基因的前面呢。腺癌才是它的主场,鳞癌里几乎见不着;而且EGFR、KRAS都是野生型的亚裔患者,被查出来ALK阳性的几率能飙到30%—42%,所以很多医生都把ALK检测放在EGFR和KRAS后面做,性价比最高了。 免疫组化(IHC)是个快速筛选手段。罗氏Ventana那个试剂盒已经被欧洲和中国都给认证了,跟FISH的结果对得很准,基本都在94%—100%这个区间里。看结果特别直观,只要肿瘤细胞的胞浆里有一簇黄棕色的小颗粒,那就是阳性;要是细胞膜上有点颜色,那就判阴性了。不过这个办法有个小毛病:因为肿瘤本身比较异质,同一块组织上的不同地方结果可能不一样;要是FFPE切片存太久了,蛋白或者RNA都容易坏,结果就得小心看了。 荧光原位杂交(FISH)才是个“金标准”,但脾气有点怪。原理其实挺简单,用两条颜色不一样的探针标记ALK的两头,基因要是断了,红绿信号就分道扬镳了。一般得数50个肿瘤细胞,超过50%有分离信号才是阳性;低于10%是阴性;卡在中间那10%—50%的话,就得再挑50个细胞看看100个里有15%以上分没分(只限雅培的试剂盒)。 这个方法也有槽点:它只告诉你有没有断裂了,到底跟谁融合了、到底融合了哪个基因完全搞不清楚;必须得找个经验丰富的病理医生来操作;而且那个15%的标准现在大家还在争论呢,肿瘤本身不太均匀加上取样有点偏差,很容易漏掉真正的阳性病人。 反转录PCR(RT-PCR)就直接把RNA逆转录成cDNA再扩增,最厉害的是能直接告诉医生融合伙伴是谁。但问题是石蜡样本里的RNA通常都坏了不少,存了两年以上的标本基本都没法用;而且它只能查已知的融合型变异,新发现的那些突变就检测不到了。 二代测序(NGS)就是一把扫描多基因的利器。把基因组切成小片段去测序,不管是ALK扩增还是新出现的融合突变都能抓住。只要一点组织就行,以后价钱下来了肯定会变成主流手段。不过现在判读的标准还没统一好,后续怎么验证还得慢慢完善。 临床实战里到底怎么选?FISH灵敏度最低了,要是样本是胸腔积液或者细针穿刺做的蜡块,直接跳过FISH比较好;IHC可以当成第一道关卡用,验出来阳性了再用FISH或者RT-PCR来确认;RT-PCR更适合用在新鲜组织或者做液态活检的标本上。现在抽血查循环肿瘤DNA(ctDNA)和循环肿瘤细胞(CTC)的方法也火起来了,给那些没法活检的患者留了一扇窗。 最后还得记住一点:没有哪一种方法是100%准的。要是结果看着模棱两可的话,赶紧换一种办法再去验证一下吧。